Selon l'ONG, l'objectif était de cacher l'ampleur de la répression.
Des images satelites montrent les fosses communes sur les sites de Buringa aux alentours de la capitale Bujumbura.
"Ces images montrent un effort délibéré des autorités de couvrir les exactions des forces de sécurité et de cacher la vérité", a indiqué Muthoni Wanyeki, le directeur régional d'Amnesty pour l'Afrique de l'Est, la Corne de l'Afrique et les Grands Lacs.
Au moins 87 personnes ont été tuées en Décembre après l'attaque d'une base militaire par des assaillants.
Selon l'Onu, le nombre de morts peut être plus élevé.
Source: BBC Afrique