Des Syriens, des Palestiniens, des Egyptiens et des Soudanais étaient à bord, dont des femmes et des enfants.
Le navire avait quitté Damiette, en Egypte, début septembre.
Deux survivants palestiniens ont affirmé que des trafiquants ont intentionnellement fait couler le bateau.
Trafic clandestin
La porte-parole de l'OIM, Christiane Berthiaume, a précisé que ces deux survivants ont été secourus jeudi, au lendemain de l’incident, précisant qu’il y a neuf rescapés au total.
L’annonce de ce drame intervient alors qu’un autre navire transportant 250 migrants a coulé au large des côtes de la Libye.
Plus de 200 personnes se seraient noyées dans ce naufrage.
Des milliers de migrants ont perdu la vie au cours des dernières années en tentant d'atteindre l'Europe sur des navires en provenance de l'Afrique du Nord et du Moyen-Orient.
La plupart voyagent à bord de bateaux surchargés et hors d’état de naviguer.
Les autorités maltaises ne se sont pas encore prononcées sur ce dernier incident.