Les assaillants ont été identifiés comme appartenant au mouvement al-Shabab.
Ils ont fait irruption dans l'enceinte de la base près de l'aéroport et ont ouvert le feu.
Al-Shabab a perpétré de nombreuses attaques contre la mission africaine depuis que le mouvement islamiste a été chassé hors de Mogadiscio il y a trois ans.
L'attaque de ce jeudi semblait bien nourrie et prenant pour cible le cœur de la mission africaine.
Le site visé sert non seulement de quartier général à l'Amisom qui est forte de 20 mille soldats, mais aussi il abrite le QG de la mission de l'Onu en Somalie de même que les ambassades du Royaume Uni et de l'Italie.
Plus de deux heures après les premiers tirs et explosions, l'Union africaine a annoncé que la situation est totalement sous contrôle.
Elle précise que plusieurs assaillants qui ont infiltré la base ont été abattus.