Des sources judiciaires et sécuritaires ont déclaré à la BBC qu'il a été légérement blessé.
Une télévision privée a rapporté que deux policiers et un civil ont également été blessés.
Un dispositif a été placé sous une voiture garée à côté de la route où son convoi devait passer.
Le procureur général a reçu des menaces de morts dans le passé.
Le 21 mai, la branche égyptienne du groupe Etat islamique (EI) avait appelé ses partisans à s'attaquer aux juges.
C'était en riposte à la pendaison d'hommes reconnus coupables d'avoir mené des attaques au nom de l'organisation jihadiste, présente également en Syrie et en Irak.
Quelques jours plus tôt, deux juges et un procureur avaient été tués par balle dans le nord du Sinaï (est).
Cette région est le théâtre d'attentats jihadistes visant habituellement les forces de sécurité.
Après la destitution par l'armée du président islamiste Mohamed Morsi en juillet 2013, M. Barakat a déféré des milliers d'islamistes devant la justice.
Des centaines d'entre eux ont été condamnés à mort,